Die sechste Staffel bietet neben den typischen Einzelabenteuern ein Wiedersehen mit zwei alten Bekannten: Von der ersten Enterprise kommt Scotty für eine Folge an Bord, und auch Q lässt sich wieder einmal blicken und stiftet wie gewöhnlich Unfrieden. Datas Lieblings-Holodeck-Szenario "Sherlock Holmes" wird noch einmal aufgenommen, und wieder will Dr. Moriarty das Holodeck verlassen. Die Raumstation Deep Space Nine ist in einer Doppelfolge Ausgangsort einer spannenden Suche nach Worfs Vater. Höhepunkt und gleichzeitig Ende ist aber ein erneuter Angriff der Borg, bei dem sich Data in die Höhle des Löwen wagt.

21 Jahre nach der ersten Folge der "Enterprise"-Serie mit William Shatner als Captain Kirk ging eine neue Besatzung an Bord. Wie schon zuvor zeichnete Gene Roddenberry für das Konzept verantwortlich, und er legte großen Wert auf die friedliche Lösung von Konflikten. Die Serie löste einen neuen "Star Trek"-Boom aus, der bislang drei weitere Serien folgten. James "Scotty" Doohan hat in einer Folge einen bemerkenswerten Gastauftritt.