Durch das im Eis der Antarktis gefundene Tor tritt ein neues Team um Dr. Elizabeth Weir und Major John Sheppard in die Pegasus-Galaxie ein. Dort entdecken sie die sagenumwobene Stadt Atlantis. Auch hier treffen die Menschen freundliche und feindliche Völker, von denen vor allem die Wraith ernst zu nehmende Gegner sind.

Basierend auf der "Stargate SG1"- Folge "Im ewigen Eis", in der das so genannte Antiker-Tor gefunden wurde, entwarf Brad Wright die Spin-off-Serie um das neue Team. Der Erfolg ließ nicht lange auf sich warten: In den USA hatte das neue Konzept das Original mit Richard Dean Anderson in der Publikumsgunst schon nach wenigen Folgen überflügelt.