Zwei Basisschiffe der Wraith sind auf dem Weg nach Atlantis. Der Antiker kehren nach Atlantis zurück. Die anfängliche Freude der Crew löst sich auf, als sich das Team dadurch gezwungen sieht, getrennte Wege zu gehen. Doch damit nicht genug - um die Wraith-Attacke auf Atlantis zu beenden, soll die Apollo, das neuste Schiff der Erde, einen präventiven Schlag ausführen. Die Mission missglückt und Atlantis versinkt wieder im Ozean - wird der Ozean die Stadt retten?

Quelle: Fox

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